杭州师范大学在国家社科重大招标项目、国家自然科学重点和优秀青年基金项目、教育部创新团队、教育部工程研究中心、教育部人文社科成果奖、军工研发等多方面取得多项突破，现有国家级科技企业孵化器1个，省部级实验室、工程研究中心、研究基地、科技创新服务平台14个，省部级创新团队9个。2017年，学校ESI国内综合排名位列第99。自然指数位居中国内地高校TOP100第69位。

现有教育部工程研究中心：“移动健康管理系统”教育部工程研究中心；教育部重点实验室（省部共建）：有机硅化学及材料技术实验室； 教育部创新团队：“手性分子合成组装及应用”创新团队；

省重点实验室：有机硅化学及材料技术实验室、浙江省城市湿地与区域变化研究重点实验室、浙江药用植物种质改良与质量控制技术重点实验室、浙江省器官发育与再生技术研究重点实验室、浙江省认知障碍评估技术研究重点实验室；

省科技创新服务平台：浙江省氟硅化学品科技创新服务平台省科技创新团队：精细化学品生产化工过程创新团队、城市湿地生态修复与资源利用创新团队、公共卫生监测与突发事件处置关键技术研究科技创新团队等多个重点实验室与专业技术团队。